Le projet de "Bibliothèque de la Paix" - à l'origine "Bibliothèque de la Méditerranée" - est né en 1997 à Naples, à l'occasion du "IIème  Forum Civil Euromed" organisé par la Fondazione Mediterraneo.En 2003, avec les accords permanents signés et, en particulier, celui avec la Bibliotheca Alexandrina (la présidente d'alors Suzanne Moubarak assistait à l'inauguration à Naples), la "Bibliothèque de la Paix" a trouvé son siège - avec une dotation initiale de 10 000 volumes - dans l'ancien « Grand Hotel de Londres » à Naples.
A cette occasion, il a été décidé de nommer la bibliothèque seulement  à la "Paix" pour impliquer le monde entier et pas seulement la région méditerranéenne.En 2016, la « Bibliothèque de la Paix » a été dédiée à Saint Jean-Paul II.